Carregant...
 

Curs de Bioinformàtica per a la Recerca Biomèdica (2a edició de 2016)

Image
Curs UEB 12, 14, 19 i 21 de Desembre de 2016, de 9 a 14h.
Enllaç curt: http://ueb.vhir.org/2016Bioinfo2

Taula de continguts:

Materials del curs

Dia 1: Introducció a la bioinformàtica i a les BD biomèdiques

Presentacions

Exercicis

Enllaços

Dia 2: Introducció a la NGS i aplicacions

Presentacions

Exercicis

Enllaços

Dia 3: Anàlisi de dades de microarrays

Presentacions

Exercicis

Enllaços

Dia 4: Anàlisi de dades de RNA-seq i significació biològica

Presentacions

Exercicis

Enllaços

Temari del curs

  1. Introducció a la Bioinformàtica
    • Els problemes que tracta la bioinformàtica
    • Aplicació de la bioinformàtica en biomedicina
  2. Bases de dades en biologia molecular
    • Consulta en bases de dades: Cercadors i navegadors genòmics
    • Cerca en bases de dades: BLAST i eines relacionades
  3. Introducció a les tecnologies de seqüenciació i ultraseqüenciació (NGS)
    • De la seqüenciació Sanger al Next Generation Sequencing
    • Aplicacions de l’ultraseqüenciació en biologia i biomedicina
  4. Aplicacions (I): Tractament de seqüències i cerca de variants
    • Pre-processat de seqüències i control de qualitat
    • Introducció a l'anàlisi de variants amb Galaxy
  5. Aplicacions (II): Anàlisi de dades d’expressió
    • Microarrays
    • RNA-seq
  6. Aplicacions (III): Anotació funcional
    • Eines d'anàlisi de significació biològica
    • Ingenuity Pathway Analysis (IPA)

A qui s'adreça el curs?

Els curs s'adreça a investigadors -pre o post docs- i professionals de la biomedicina que desitgin aplicar la bioinformàtica en els seus estudis o que, simplement, vulguin entendre millor els estudis realitzats pels bioinformàtics que els donen suport.

Dates, places, horaris i lloc de realització

El curs té una durada de 20 hores.
Consisteix en 4 sessions de cinc hores.
Hi haurà 18 places.
Les sessions es faran el dies 12, 14, 19 i 21 de desembre de 2016, de 9 a 14h a l'aula d’informàtica del Mòdul Sud de la Facultat de Medicina (Pavelló Docent) de l'Hospital Universitari Vall d'Hebron.

Professorat

El curs està organitzat per la Unitat d'Estadística i Bioinformàtica (UEB) i la Unitat d'Alta
Tecnologia (UAT) del Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR).
El curs serà impartit pel cap de la UEB, el Dr. Álex Sánchez, professor titular del departament d'Estadística de la Universitat de Barcelona, i per membres de la UEB/UAT, el Sr. Ferran Briansó, llicenciat en Biologia i màster en Bioinformàtica, i el Dr. Ricardo Gonzalo, Dr. en Biologia molecular i PG en Bioestadística.

Organització

El curs es farà en un aula d’ordinadors de forma que no cal que els alumnes portin ordinadors. La metodologia serà de caire teòrico-pràctic. Cada sessió es dividirà en una part d'exposició teòrica seguida o intercalada amb parts pràctiques on els alumnes treballaran en grups d'una o dues persones.

Quotes d'inscripció

L'import dels cursos varia segons si s'és membre del VH, de l'esfera UAB o extern a aquestes.
Els preus són els següents:

  • Membres de Vall Hebron (VHIR/VHIO/HUVH) 130€
  • Membres d’Esfera UAB o membres de l’Associació BIB 250€
  • Altres 500€


Noms alias d'aquesta pàgina

2016BRB2 | 2BRB2016 | 2016Bioinformatica2 | 2016Bioinfo2 | 2016 BRB 2 | 2016 Bioinformatica 2 | 2016 Bioinfo 2 | 2016BRB2 | 2016BBR2

Més info

Per qualsevol dubte podeu contactar per mail amb Ferran Briansó (ferran.brianso@vhir.org) o per telèfon al 934894007.